Visualisasi Proses Pemurnian dan Isolasi Sebagian Pada Protein Spike Virus Sars-Cov 2 varian 7N0R dengan aplikasi pymol

Authors

  • Nindy Aprillia Rindiany Universitas negeri padang, fakultas matematika dan ilmu pengetahuan alam,daparteman kimia,padang,indonesia
  • Selsa Arlini Pendidikan Kedokteran, Fakuktas Kedokteran, Universitas HKBP Nommensen, Medan, Indonesia
  • Frayengka Alfaga Teknik Elektro dan Industri, Fakuktas Teknik, Universitas Negeri Padang, Padang,Indonesi

Abstract

Penelitian ini mengkaji komputasi purifikasi dan isolasi virus spike protein Sars-Cov-2 varian 7N0R menggunakan aplikasi PyMol. Metode yang saya gunakan dalam penelitian ini adalah pemodelan molekul menggunakan software PyMol versi 2.5.2 yang diterbitkan oleh Schrödinger. Perangkat yang digunakan adalah Acer Aspire A514-54. . Ada beberapa tahapan dalam melakukan penelitian ini. Pertama, spike protein dipilih untuk digunakan di situs web https://www.rcsb.org/. Protein yang digunakan adalah varian spike Sars-Cov-2 7N0R. Tahap selanjutnya adalah pemurnian dan isolasi selektif menggunakan aplikasi PyMol. Pemurnian dilakukan dengan menghilangkan air terlebih dahulu, kemudian memilih dan menghilangkan ligan asli, kemudian presetting dan memilih cartoon. Hasil yang diperoleh dari prosedur ini adalah virus spike protein murni Sars-Cov-2 varian 7N0R dengan struktur bebas air, bebas ligan asli dan bebas pengotor lainnya.

Downloads

Published

2022-06-13

Issue

Vol. 1 No. 01 (2022): MATH-SMART

Section

Articles