Studi Molekular dengan Pymol pada Purifikasi dan Isolasi Selektif Protein Spike Varian 6WZQ Virus Sars–Cov–2

Authors

  • Silvia Afendi Jurusan Kimia, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Negeri Padang, Indonesia
  • Fiki Of Fernando Pendidikan Kedokteran Hewan, Kedoketran Hewan, Universitas Syiah Kuala, Aceh, Indonesia
  • Zulaika Widia Erita Matematika, Univeristas Andalas, Padang, Indonesia

Keywords:

Purifikasi dan Isolasi, Pymol, Protein Varian Spike 6WZQ Sars-Cov-2

Abstract

Riset ini bertujuan untuk analisismolekular dengan Pymol pada purifikasi dan isolasi selektif protein spike varian 6WZQ virus Sars–Cov–2. Metode yang digunakan adalah pemodelan molekul dengan aplikasi Pymol versi 2.5.2 yang dikeluarkan oleh Shcrodinger. Riset ini memiliki dua kajian yaitu Purifikasi dan Isolasi Selektif Protein Spike Varian 6WZQ Virus Sars–Cov–2. Protein yang dipakai adalah protein varian spike Sars-Cov-2 yang disiapkan dari purchem http://www.rscb.org/structure/6WZQ . Analisis pemodelan ini menggunkan perangkat keras komputer dengan spesifikasi Intel(R) Celeron(R) CPU N2840 @ 2.16GHz   2.16 GHz dengan Istalled RAM 2,00 GB (1,88 GB usable). Hasil ini didapatkan dari varian yang diisolasikan adalah spike protein Sars-Cov-2 6WZQ. Hasil dari penelitian ini berupa protein Sars-Cov-2 varian 6WZQ yang telah dimurnikan dari air, natif ligand dan pengotor lainnya.

Downloads

Published

2022-06-13