Studi Komputasi Protein Spike Virus Sars-Corv-2 Varian 6VYB pada Aspek Pemurnian dan Isolasi Selektif dengan PyMol

Authors

  • Farras Aulia Sugria Kimia, Fakultas Matermatika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Negeri Padang, Padang
  • Muhammad Afif Pendidikan Teknik Bangunan, Fakultas Teknik, Universitas Negeri Malang, Malang, Indonesia
  • Yusma Hartini Ilmu Kelautan, Fakultas Ilmu Kelautan dan Perikanan Universitas Maritim Raja Ali Haji, Tanjung Pinang, Indonesia

Keywords:

Keywords: Spike Sars-Corv-2; Varian 6VYB; PyMOL

Abstract

Studi riset ini bertujuan untuk menganalisis studi komputasi protein spike virus Sars-Corv-2 varian 6VYB pada aspek pemurnian dan isolasi selektif dengan menggunakan PyMol. Dalam hal ini metode yang digunakan yaitu pemodelan molekuler dengan menggunakan aplikasi PyMol versi 2.5.2 dikeluarkan oleh Schödinger, LLC. Riset ini menggunakan terdapat aspek yaitu pemurnian dan isolasi selektif. Protein yang digunakan terhadap salah satu varian protein spike virus yaitu Sars-Corv-2, yang disiapkan dari situs https://www.rcsb.org/. Analisis komputansi degan menggunakan perangkat keras komputer dengan spesifikasi processor AMD Pro A10-8700B R6, 10 Computer Cores 4C + 1.80 dengan RAM 8.00 GB. Varian yang dimurnikan dan diisolasi yaitu 6VYB, Sehingga menghasilkan protein murni protein spike virus Sars-Corv-2 varian 6VYB. Diperoleh varian 6VYB dihasilkan dalam bentuk remove water dan ligand sites. Pemurnian dan isolasi varian 6VYB berhasil memisahkan air dan pengotor lain pada protein target.

Downloads

Published

2022-06-13

Issue

Vol. 1 No. 01 (2022): IKLIM KELAS

Section

Articles