Implementasi Pymol pada Analisis Protein Spike Virus Sars-Cov-2 Variansi 7NLL pada Sisi Pemurnian dan Isolasi Selektif

Authors

  • Annisa Septiani Putri Departemen Kimia, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Negeri Padang, Padang, Sumatera Barat, Indonesia
  • Gemilia Elvarino Arsitektur Lanskap, IPB University, Bogor, Indonesia
  • Fanissa Rahmatikasari Teknik Mesin, Universitas Andalas, Padang, Indonesia

Keywords:

PyMol; Sars-Cov-2; Spike Protein

Abstract

Riset ini bertujuan untuk mengimplementasikan aplikasi Pymol pada analisis protein spike virus sars-cov-2 variansi 7NLL pada sisi pemurnian dan isolasi selektif. Metode yang digunakan adalah pemodelan molekul dengan aplikasi Pymol versi 2.5.2. Riset ini menghasilkan pemurnian dan isolasi selektif pada spike protein. Protein yang digunakan adalah spike virus sars-cov-2 variansi 7NLL yang disiapkan dari situs www.pdb.org. Analisis menggunakan perangkat lunak dengan spesifikasi prosesor i5 RAM 8 GB. Hasil dari riset ini diperoleh spike virus sars-cov-2 variansi 7NLL yang sudah dimurnikan dan diisolasi berbentuk visualisasi remove water, dan visualisasi ligan. Pemurnian dan isolasi variansi 7NLL berhasil memisahkan air, dan Pengotor lain pada protein target.

Downloads

Published

2022-06-12

Issue

Vol. 1 No. 01 (2022): GEO-SMART

Section

Articles